Doğum öncesinde bebeğin hastalıklarının araştırılması ve tanı konması için yapılan işlemlere prenatal tarama ve tanı yöntemleri denir. Tanı konmaya çalışılan hastalıklar arasında başta Down Sendromu olmak üzere kromozom hastalıkları, genetik hastalıklar, yapısal bozukluklar ve sendromlar yer alır. Prenatal tanı yöntemleri arasında ikili, üçlü, dörtlü tarama testleri, AFP gibi biyokimyasal yöntemler, cffDNA gibi genetik yöntemler, amniyosentez, kordosentez ve koryon villus biyopsisi gibi girişimsel yöntemler, ultrason ve MR gibi görüntüleme yöntemleri bulunur.

Prenatal testler dendiğinde akla ilk gelen Down Sendromudur. Down sendromunun prenatal taraması için yapılan ikili, üçlü ve dörtlü tarama testleri biyokimyasal testlerdir. Bu testlerin tanı koyma oranı %80-85 arasındadır.

Bu testler ile fetusta risk yüksek bulunursa tanı testleri uygulanır. Tanı testleri arasında en iyi bilinenler, amniyosentez, koryon villus biyopsisi ve kordosentezdir. Bu yöntemler ile Down sendromuna %100’e yakın oranda tanı koyulabilir. Ancak bu girişimsel testler yapıldığında %0,5 oranında bebek kaybı ile sonuçlanır.

Son yıllarda gün geçtikçe daha sık uygulanan cffDNA yöntemleri ile Down Sendromu %99’u geçen oranlarda saptanabilmektedir.

Prenatal Hastalıklar

Genetik Hastalıklar

Genler ve Kromozomlar

Down Sendromu

Down Sendromu Nedir

Tarama Testleri

Tarama Testlerinde Terimler

İkili Tarama Testi

Üçlü Tarama Testi

Tanı Testleri

Amniyosentez

Görüntüleme Yöntemleri

Ultrason

The post Prenatal Tanı appeared first on İzmir Karşıyaka Kadın Doğum Merkezi.

Yazılım özel olarak bu amaç için geliştirilmiş olup, elde edilen dizileri ilgili kromozomlarla eşleştirmekte ve 21. kromozoma ait genetik materyalin miktarını belirlemektedir. Buradaki miktar, kalite kriterlerini sağlayan dizilerin içindeki yüzde olarak belirtilmektedir.

Doğrulanmış bir algoritma kullanılarak, 21. kromozoma ait DNA miktarının, diploid kromozom seti bulunduran olgulardaki normal değer aralıklarını aşıp aşmadığı hesaplanır. Normal aralık bir Gaus Çan Eğrisi ile gösterilebilir. Z-skoru olarak da belirtilen istatistik değeri hesaplanır. Z-skoru, çalışılan örneğin içindeki 21. kromozom miktarının referans alınan örnek grubundan ne kadar farklı olduğunun Ortalama Mutlak Sapma (MAD) cinsinden göstergesidir.

Z-skoru, trizomi 21 olmayan gebeliklerde 3 SD değerinin altında saptanır. Bu gibi normal gebeliklerde z-skorunun dağılımı Gaus çan eğrisinin normal dağılımı şeklindedir. Z-skoru 3 veya daha fazla ise bu sıklıkla trizomi 21 varlığına işaret eder. Eğer çalışılan örneğin değeri, referans alınan örnek grubunun ortalamasından 3 (üç) ortalama mutlak sapma (MAD) gösteriyorsa, bu demektir ki %99.87 olasılık ile kantitatif olarak anlamlı bir şekilde 21. kromozom fazlalığı var demektir.

Eğer 21. kromozoma ait genetik materyal miktarı belirlenemez ise, NİPT sonucu “sonuç yok” olarak gelecektir. Dolayısıyla da testi isteyen uzman doktorun, NİPT ile trizomi 21 tanısı koyması mümkün olmayacaktır. Yeniden kan alınarak testin tekrarlanması gerekecektir.

https://izmirkarsiyakakadindogummerkezi.com/niptin-yazilimi/

The post NIPTin Yazılımı appeared first on İzmir Karşıyaka Kadın Doğum Merkezi.

Güncel bildirilerinde, Uluslararası Prenatal Tanı Derneği (International Society for Prenatal Diagnosis – ISPD) ve Profesyonel Perinatoloji Uzmanları Derneği (Professional Association of Practising Prenatal Physicians – BVNP), anlaşılır ve açıklayıcı bir şekilde tamamlayıcı bilgilendirme yapılması gerektiğini belirtmektedir.

Bir tarama testi olduğundan sonuç kromozom bozukluğu var veya yok şeklinde değil yüksek olasılıkla şu veya bu şeklinde raporlamaktadır.

NİPT, sonucu z-skoru şeklinde bildirir. Z-skoruna göre uzman doktor trizomi 21 tanısını yüksek bir doğrulukla onaylar veya dışlayabilir.

NIPT sonuçlarına göre izleyen adımlar

1. Normal NIPT sonucu: Ultrason muayenesinde fetusta her hangi bir anormallik saptanmıyorsa ileri tetkik ve izleme gerek yoktur.
2. Test başarısızlığı: Olguların bir kısmında yeterli fetal DNA elde edilemediğinden test uygulanamaz.
3. Anormal NIPT sonucu: Eğer sonuçlar anrmal bulunmuş ise gebeliğin sonlandırılmasından önce amniyosentez veya koryom villus biyopsisi ile doğrulama yapılmalıdır.
4. https://izmirkarsiyakakadindogummerkezi.com/nipt-raporu/

The post NIPT Raporu appeared first on İzmir Karşıyaka Kadın Doğum Merkezi.

NIPT’te testin sonuç verememe oranları %1-%8 arasında değişmektedir ve ciddi bir sorundur.

Üç nedene bağlıdır;

• Materyelin laboratuvara ulaşması,
• Testte başarısızlık ve
• Yetersiz DNA

Sınırlı sayıda gebede anne kanından yeterli DNA elde edilemediğinden NIPT yapılamaz. NIPT yapılamamış olması fetusta bir kromozom hastalığı veya başka hastalığın varlığını göstermez. Ancak kromozom anomalisi olasılığının arttığı akılda
tutulmalıdır.

Bu gebelerde NIPT için yeniden anne kanı alınıp test tekrarlanabilir.

https://izmirkarsiyakakadindogummerkezi.com/nipt-ile-sonuc-alinamamasi/

The post NİPT İle Sonuç Alınamaması appeared first on İzmir Karşıyaka Kadın Doğum Merkezi.

NIPT’de Sonuçların güvenilirliği ve trizomiyi ekarte etme hassasiyeti çok yüksektir.

NIPT, genellikle Trizomi 21 (T21), Trizomi 18 (T18), Trizomi 13 (T13) gibi daha sık görülen kromozom anormallikleri için tarama testi olarak kullanılmaktadır.

• Pozitif Öngörü Değeri (PPV)

  Test sonucu pozitif (Yüksek riskli) çıkmış ise bebekte gerçekten hastalığın bulunma olasılığıdır.

  PPV (Testin hasta çocuğa tanı koyma oranı), anne adayının riski yüksek ve düşük olduğunda farklı sonuçlar verir. Yüksek riskli grupta tanı koyma oranı %83, düşük riskli grupta %33’tür.

• Negatif Öngörü Değeri (NPV)

  Test sonucu negatif (Düşük riskli) çıkmış ise bebekte gerçekten hastalığın bulunmama olasılığıdır.

  NPV (Testin sağlıklı çocuğa tanı koyma oranı), anne adayının riski yüksek veya düşük olduğunda fark etmez. Sağlıklı çocukların %99’dan fazlasına sağlıklı tanısı konur. Yani amniyosentez oranı çok düşüktür.

Down Sendromu

Anne adayının yaşına göre Down Sendromu riski yüksek olan (35 yaş üzerindeki) kadınlarda testin güvenilirliği;

• PPV

  83%

  Test sonucu pozitif çıkan 100 anne adayından 83 tanesinin bebeği Down Sendromu, 17 tanesinin bebeği sağlıklı olacaktır.

• NPV

  99%

  Test sonucu negatif çıkan anne adayında Down Sendromlu bebeğe rastlama oranı çok düşüktür.

Anne adayının yaşına göre Down Sendromu düşük yüksek olan (35 yaş altındaki) kadınlarda testin güvenilirliği;

• PPV

  33%

  Test sonucu pozitif çıkan 100 anne adayından 33 tanesinin bebeği Down Sendromu, 67 tanesinin bebeği sağlıklı olacaktır.

• NPV

  99%

  Test sonucu negatif çıkan anne adayında Down Sendromlu bebeğe rastlama oranı çok düşüktür.

Testin Farklı Trizomilerde Tanı Koyma Oranının Kıyaslanması

Farklı ticari testlerin duyarlılığı (Tanı koyabilme oranı) ve özgüllüğü (Koyulan tanının doğru olma oranı) birbirinden farklıdır. Elde edilen fetal DNA oranı çok az ise test çalışılamaz. Bu test başarısızlığı olarak değerlendirilir. Farklı ticari testlerin test başarısızlığı kriteri ve oranları da farklıdır. cffDNA’nın kaynağı trofoblast hücreleri olduğundan %1-1,5 oranında plasentada gözlenen plasenta ile sınırlı mozaisizmin yanlış pozitif ya da yanlış negatif tanıya yol açabileceği kabul edilmektedir.

İkiz gebeliklerde; duyarlılık ve özgüllük daha düşüktür.

• Hücreden sıyrılmış DNA testleri, sık rastlanan kromozom sayı anormalliklerinin, yüksek riskli gebeliklerde araştırılması için iyi bir tarama testi olmakla birlikte bazı sınırlamaları vardır.
• Test sonucunun negatif çıkması Down Sendromu gibi kromozom sayı anormalliklerinin olmadığının kesin göstergesi değildir.
• Test sonucu pozitif bulunmuş ise bebeğin gerçekten hasta olduğunun saptanması için amniyosentez yapılması şarttır. Özellikle riski düşük olan 35 yaş altındaki genç anne adaylarında test pozitif bulunduğu halde bebeğin sağlıklı olma olasılığı daha yüksektir.
• NIPT, başlıca üç kromozomun trizomileri dışındaki hastalıklarda tanı koydurucu değildir. Bu nedenle nöral tüp defekti, kalp hastalığı ve benzeri hastalıkların taraması için ultrason ile fetal muayene yapılması gereklidir.

The post NIPT Sonuçlarının Doğruluk Oranı appeared first on İzmir Karşıyaka Kadın Doğum Merkezi.

Genetik bilgilendirmeyi takiben NIPT için hastadan onam alınır.

NIPTleri Nasıl Yaptırırsınız?

Farklı ticari firmaların testlerinin yapılma zamanları farklıdır.

Anneden özel olarak hazırlanmış tüplere iki tüp kan alınır. Her iki tüp tamamen doldurulmalıdır.

Tüpler alındıktan sonra kendi özel kitlerinde taşınmalıdır.

Laboratuarda önce plazma ayrılır.

Sonra serbest genetik materyal (cfDNA) plazmadan saflaştırılır.

Bu saflaştırma işleminde çok az miktarda genetik materyal elde edilir. Analiz için bir ‘genomik bilgi’ oluşturulmalı ve çoğaltılmalıdır.

Ortaya çıkan DNA parçacıkları analiz cihazları kullanılarak ayrıştırılır. Elde edilen diziler belirlenen kriterlere göre sınıflandırılır.

Son değerlendirme bilgisayar yazılımı kullanılarak tamamlanır.

NIPT, materyelin laboratuvara ulaşmasından iki hafta sonra sonuçlanır.

https://izmirkarsiyakakadindogummerkezi.com/niptleri-nasil-yaptirirsiniz/

The post NIPTleri Nasıl Yaptırırsınız appeared first on İzmir Karşıyaka Kadın Doğum Merkezi.

Anne adayının kan dolaşımında kendi DNA’sının yanısıra, plasentayı geçip gelen bebeğe ait DNA molekülleri de dolaşır. Serbestçe dolaşan bu DNA parçalarının her birinin hangi kromozomun bir parçası olduğu saptanabilir. Bu durumda bebeğin kromozomlarından birinin sayı anormalliği, o kromozoma ait DNA’nın miktarına bakılarak tahmin edilebilir. Bunun için anne adayının kolundan az miktarda kan almak yeterli olacaktır.

NİPT, anne kanından yapılır. Anne kanında cfDNA analizinde, plasentadan annenin kanına karışan plasenta hücrelerine ait hücre dışı DNA (gen) parçacıkları kullanılır. Plasenta hücrelerinin DNA’sı bebek hücrelerininki ile aynıdır.

DNA, parçalanan plasenta hücrelerinden kaynaklanır ve sürekli olarak anne kanına salınır. Bu DNA, 2 saatten kısa ömürlüdür. Doğum sonrası maternal kandaki miktarı hızla azalmakta ve doğumdan iki saat sonra ise gösterilememektedir.

Anne adayının kan dolaşımında gebelik boyunca bebek ve anneye ait, hücreden sıyrılmış DNA parçaları (cfDNA – cell free DNA) bulunur. Bu DNA fragmanları ile bebekte trizomilerin bulunup bulunmadığı araştırılabilir. Bu genetik materyal, hücre dışında olup küçük parçacıklar halindedir ve anne kanında serbest olarak dolaşmaktadır.

NİPT ile fetal kaynaklı 21. kromozom parçacıklarının (cffDNA) artışı Yeni Nesil Dizileme (NGS) yöntemi ile saptanarak Trizomi 21 (Down Sendromu) tanısını koymak mümkün olmaktadır.

Örneğin maternal kanda 100 adet 21. kromozom parçacığının dolaştığını varsayalım. Diploid fetüslerde bunlardan yaklaşık 10 tanesi fetal 90 tanesi ise maternal kaynaklı olacaktır. Trizomili bir fetüs olması halinde ise toplamda 105 adet 21. kromozom parçacığı olacak ve bunlarda 15 tanesi fetal 90 tanesi ise maternal kaynaklı olacaktır. NİPT yöntemi ile güvenilir bir şekilde işte bu 1:1.05’lik fark saptanmaktadır.

Yöntem 10. gebelik haftasından itibaren uygulanabilir.

11-13. gebelik haftalarında yaklaşık %10 olan anne  kandaki bebek DNA’sı oranı, gebelik haftası ile artmakta ve genel olarak %3-20 arasında değişmektedir.

The post NIPTlerin Mantığı appeared first on İzmir Karşıyaka Kadın Doğum Merkezi.